膠原酶是一種從細菌中提取出來的酶，對膠原有很強的消化作用。適于消化纖維性組織、上皮組織以及癌組織，它對細胞間質有較好的消化作用，對細胞本身影響不大，可使細胞與膠原成分脫離而不受傷害。該酶分離效果好，即使有鈣、鎂離子存在仍有活性，故可用 PBS 和含血清的培養液配制，即操作簡便又可提高細胞成活率，zui終濃度 200u/mL 或 0.1~0.3mg/mL. 此酶消化作用緩和，無需機械振蕩，但膠原酶價格較高，大量使用將增加實驗成本。

  經過膠原酶消化后的上皮組織，由于上皮細胞對酶有耐受性，可能有一些上皮細胞團塊尚未被*消化開。成小團塊的上皮細胞比分散的單個上皮細胞更易生長，因此不必要再進一步消化處理。

   鑒于胰蛋白酶和膠原酶的生物學活性（見表 4-1）和在不同濃度下消化各種組織小塊所需的時間（小  時）有差異（見表 4-2），以及兩者價格不等，有人采用膠原酶與胰蛋白酶并用，同時還可加透明質酸酶（對細胞表面糖基有作用），采用兩者的聯合消化作用，對分散大鼠和兔肝、癌組織非常有效。